O filtro biológico é uma coisa fundamental em aquários; a sua função é remover nutrientes indesejados como nitrato e amônia. O filtro biológico ou biofiltro consiste em mantermos um substrato com grande área de superfície aonde se alojarão bactérias denitrificantes (tipicamente dos gêneros Nitrospira, Nitrosomonas e Nitrobacter). Essas bactérias fazem a oxidação e consumo dos nutrientes.

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